География бактериального сопротивления
Устойчивость к антибиотикам, вызванная их неконтролируемым применением в медицине и сельском хозяйстве, является глобальной проблемой здравоохранения. Предполагается, что уже к 2050 году около 10 миллионов человек будут ежегодно умирать из-за антибиотикорезистентности. Хотя именно устойчивые патогенные микроорганизмы являются основной проблемой, не стоит забывать про обширные каналы обмена генов, существующие между неродственными микробными таксонами, которые позволяют комменсалам делиться генами устойчивости с оппортунистами. Микробиота кишечника человека, как самое крупное микробное сообщество, все чаще рассматривается как довольно важный, в клиническом плане, резервуар лекарственной устойчивости. Пул генов устойчивости к антибиотикам (AR), который активно пополняется во время лечения антибиотиками, становится своего рода пороховой бочкой: передача этих генов патогенному микроорганизму имеет тяжелые последствия как для пациента, так и для его микробиоты.Полуколичественный анализ функционального состава микробиоты человека позволяет оценить приблизительное количество генов AR и, таким образом, помогает в персонализированном прогнозировании способности микробиоты в развитии инфекций с резистентными возбудителями. Опубликованные массивные объемы метагеномов помогают оценить различия в резистентности между здоровыми популяциями и клиническими испытуемыми группами. Тем не менее, сегодня существует нехватка визуальных инструментов для анализа таких данных, что стало причиной появления карты мира бактериальной резистентности. Данная карта резистентности, ResistoMap, является интерактивным инструментом комплексной визуализации резистентности кишечника в популяциях мира. Показано относительное обилие AR-генов, мутации AR-conferring, а также генов, придающих устойчивость к биоцидам и тяжелым металлам.
ResistoMap – перспективный инструмент для изучения глобальной резистентности микробиоты кишечника с целью выявления национальных особенностей в потреблении антибиотиков, корреляции состава резистентных штаммов с различными внешними факторами, и в последствии разработки стратегии выхода из сложившейся ситуации.
Источники
- Yarygin K. S. et al. ResistoMap—online visualization of human gut microbiota antibiotic resistome //Bioinformatics. – 2017.
- http://resistomap.rcpcm.org/ (ссылка на саму интеррактивную карту, с прогрузкой страницы могут быть проблемы)
